[Variability of the D-Loop Sequence of Mitochondrial DNA in Transbaikal Horses].

Abstract: The Zabaikalskaya horse is an indigenous breed of horses from Siberia with diverse use. It is characterized by endurance and good adaptability to year-round herd maintenance in the harsh conditions of the Baikal steppes. To determine the genetic characteristics of the maternal lineage of the Zabaikalskaya horse breed based on mitochondrial DNA polymorphisms, we collected hair samples from 31 horses belonging to breeding farms in the Trans-Baikal Territory. Analysis of the 530 bp sequence of the mtDNA D-loop was performed using the maximum composite likelihood (MCL) model in combination with bootstrap analysis. When studying the polymorphism of the hypervariable region of the mtDNA D- loop in Zabaikalskaya horses, we identif ied 31 haplotypes representing 8 haplogroups: B, C, G, H, L, M, Q and R according to modern classif ication. The sequenced fragment of the D-loop from nucleotide position 15471 to 16000 contained 17 polymorphic sites, mainly represented by the A→G, G→A and T→C transitions. The haplogroups Q (25.81 %), B (19.35 %), G (16.13 %) and H (12.90 %) were prevailing in the mtDNA structure of this breed. Genetic analysis of the mitochondrial genome of the Zabaikalskaya horse revealed a high level of diversity of haplotypes and haplogroups, which are typical for the horse populations of Eurasia. Забайкальская лошадь – аборигенная порода лошадей Сибири универсального использования. Она характеризуется выносливостью и хорошей приспособленностью к круглогодичному табунному содержанию в суро- вых условиях байкальских степей. Для определения генетических особенностей материнских линий забайкальской породы на основе полиморфизмов митохондриальной ДНК мы собрали образцы волос от 31 лошади, принадлежащей племенным хозяйствам Забайкальского края. Анализ последовательности D-петли мтДНК размером 530 п. н. проводили с использованием модели максимального правдоподобия (MCL) в сочетании с бутстрэп-анализом. При изучении полиморфизма гипервариабельного региона D-петли мтДНК у забайкальских лошадей был выявлен 31 гаплотип, представляющий восемь гаплогрупп: B, C, G, H, L, M, Q и R, согласно современной классификации. Секвени- рованный фрагмент D-петли (нуклеотидная позиция 15471–16000) содержал 17 полиморфных сайтов, в основном представленных транзициями A→G, G→A и T→C. В структуре мтДНК породы преобладали гаплогруппы Q (25.81 %), B (19.35 %), G (16.3 %) и H (12.90 %). Генетический анализ митохондриального генома забайкальской лошади выявил высокий уровень разнообразия гаплотипов и гаплогрупп, которые типичны для популяции лошадей Евразии.